Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms