Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNA2P26232 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms