Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PTPRBP23467 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PTPRBP23467 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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