Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNNI3P19429 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms