Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPGDP15428 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HPGDP15428 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPGDP15428 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPGDP15428 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPGDP15428 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPGDP15428 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPGDP15428 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPGDP15428 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPGDP15428 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPGDP15428 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPGDP15428 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPGDP15428 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPGDP15428 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPGDP15428 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPGDP15428 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPGDP15428 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPGDP15428 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPGDP15428 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HPGDP15428 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HPGDP15428 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HPGDP15428 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms