Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms