Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTPRFP10586 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTPRFP10586 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTPRFP10586 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTPRFP10586 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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