Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms