Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX6O95503 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBX6O95503 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBX6O95503 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBX6O95503 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBX6O95503 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX6O95503 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX6O95503 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX6O95503 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms