Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

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Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTOA8MTQ0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTOA8MTQ0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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