Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVW-1Q9UQF0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms