Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms