Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms