Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTNAP2Q9UHC6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms