Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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