Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHPF2Q9P2E5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms