Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SH3BP4Q9P0V3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SH3BP4Q9P0V3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SH3BP4Q9P0V3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SH3BP4Q9P0V3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SH3BP4Q9P0V3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SH3BP4Q9P0V3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SH3BP4Q9P0V3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SH3BP4Q9P0V3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SH3BP4Q9P0V3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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