Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms