Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT82Q9NSB4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms