Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRP1Q9C000 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP1Q9C000 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms