Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV99

LRRC61, Leucine-rich repeat-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC61Q9BV99 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC61Q9BV99 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC61Q9BV99 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms