Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms