Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms