Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPNS2Q96L46 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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