Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMNQ96JQ2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMNQ96JQ2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMNQ96JQ2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMNQ96JQ2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMNQ96JQ2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMNQ96JQ2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMNQ96JQ2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMNQ96JQ2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMNQ96JQ2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMNQ96JQ2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMNQ96JQ2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMNQ96JQ2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMNQ96JQ2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMNQ96JQ2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMNQ96JQ2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMNQ96JQ2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMNQ96JQ2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMNQ96JQ2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMNQ96JQ2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms