Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms