Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms