Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD2Q96BF3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms