Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms