Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFRP1Q8N474 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SFRP1Q8N474 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFRP1Q8N474 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms