Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC103Q8IW40 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms