Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.05■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms