Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFWD3Q6PCD5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms