Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL2Q6F5E8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms