Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms