Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP135Q66GS9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP135Q66GS9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms