Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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SAMD13Q5VXD3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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SAMD13Q5VXD3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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