Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC7Q5VTL7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms