Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms