Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR44Q5JSH3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms