Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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