Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms