Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms