Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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