Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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