Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRRQ15256 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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