Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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