Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms