Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ATP1A4Q13733 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ATP1A4Q13733 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ATP1A4Q13733 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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