Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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